生物学实验 质粒DNA的提取

实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)

一、实验目的

了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。

二、实验原理

碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。

三、仪器设备

微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。

四、实验试剂

(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。4 ℃贮存。

(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。

(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。

(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。

五、 实验方法

(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。

(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。

(3)取菌液1.0 mL于1.5 mL的Eppendorf 管中,将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速3 500 g,离心5 min,收集细菌。弃上清,倒置于吸水纸上,沥干残液。

(4)每离心管中加入冰上预冷的溶液Ⅰ 200 µL,置振荡器上剧烈震荡,悬浮菌体。

(5)加入新配制的溶液Ⅱ 400 µL,翻转10次。冰上放置。

(6)冰浴3 min内迅速加入300 µL溶液Ⅲ,温和翻转10次,冰浴10 min。

(7)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心5 min。取上清液于新管中,同时加入Rnase(10 mg/mL)10 µL,混匀,37 ℃保温2 hr。

(8)加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),置摇床上震荡5 min,将离心管放入冷冻离心机,调温至4℃,转速12000 g,离心10min。

(9)取上清液于新的离心管内,加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),摇床震荡5 min。

(10)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心10 min。取上清,加入等体积异丙醇,迅速翻转5次,冰上放置10 min。

(11)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心10 min。弃上清,倒置于吸水纸上。加入500 μL 70 %的乙醇轻振,洗涤沉淀。

(12)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心10 min。弃上清,室温干燥沉淀30 min。

(13)加入20 μL无菌水溶解DNA,电泳检测。

六、实验结果

七、提取质粒DNA过程中应该注意的问题

(1)细菌细胞的裂解是分离质粒DNA的关键步骤。通常可以加入溶菌酶或SDS促使大肠杆菌细胞裂解。如果细菌细胞没有完全裂解,会明显降低质粒DNA的回收率。理想的状况是每一个细菌细胞都能够被充分破裂使质粒DNA顺利溢出,而又没有污染过多的染色体分子。

(2)质粒提取过程中,除规定的实验条件外,应尽量保持低温,避免过酸过碱,操作过程中手法要温和,尽可能避免脱氧核糖核酸酶(DNase)对质粒DNA的降解和破坏。

(3)电泳时上样孔中如果有白色物质,是由于蛋白质没有去除干净。

(4)质粒共有三种构型:

共价闭合环形DNA(cccDNA):质粒的两条多核苷酸链均保持着完整的环形结构,这样的DNA通常呈现超螺旋的SC构型;开环DNA(ocDNA):质粒的两条多核苷酸链中一条保持着完整的环形结构,另一条链出现有一或数个缺口,即OC构型;线性分子(l DNA):质粒DNA经过适当的核酸限制内切酶切割之后,发生双链断裂而形成线性DNA分子,通称L构型。相同分子质量质粒的三种构型在正常情况下电泳时,迁移速率分别是:超螺旋DNA比线性的DNA迁移率大,线性DNA比开环DNA迁移率大。

八、作业

(1)按要求认真撰写报告,包括实验目的、实验原理、实验用品及药品、实验步骤等,要详细阐述质粒提取的基本原理。

(2)提取质粒DNA过程中应该注意的问题是什么?

(3)质粒DNA的三种构型及在正常电泳条件下的迁移情况如何?

 

第二篇:高中生物必修二实验十一__DNA的粗提取与鉴定

实验十一 DNA的粗提取与鉴定

教学目的

1. 初步掌握DNA粗提取和鉴定的方法。

2. 观察提取出来的DNA物质。

实验原理

1. DNA在NaCl溶液中的溶解度是随NaCl的浓度变化而改变的。DNA在0.14mol/L的NaCl

溶液中的溶解度最低,据此可使溶解于NaCl溶液中的DNA析出。

2. DNA不溶于酒精溶液,但细胞中某些物质可以溶于酒精溶液,据此可提取杂质较少的DNA。

沸水浴3. DNA+二苯胺????蓝色(用于DNA的鉴定)

实验步骤

1.材料制备

0.1G/ml柠檬酸钠

高中生物必修二实验十一DNA的粗提取与鉴定

500ml烧杯→玻璃棒搅拌→1000r/min离心2min→吸去上清液→ 活鸡血 即得鸡血细胞液(也可将上述烧杯臵于冰箱中,静臵一天使鸡血

细胞自行沉淀)

2.方法步骤

取血细胞液5-10ml+20ml蒸馏水,玻璃棒沿一个方向快速搅拌

(1纱布过滤,滤液中含DNA和其他核物质,如蛋白质

原理:血细胞的细胞膜、核膜吸水胀破,玻璃棒快速搅拌机械加

速血细胞破裂

(2)溶解核内DNA:滤液+2mol/LNaCl溶液40ml,玻璃棒沿一个方向搅拌

(3DNA的粘稠物:向上述溶液中缓缓加入蒸馏水,并轻轻地沿一个方向搅拌,出

现丝状物,当丝状物不再增加时,停止加水(此时NaCl溶

液相当于稀释到0.14mol/L)

(4)滤取含DNA的粘稠物:用多层纱布过滤,含DNA的粘稠物留在纱布上

(5)(纱布上的)DNAmol/LNaCl溶液烧杯,

上述粘稠物3 min

(6DNA的2mol/LNaCl溶液:用2层纱布过滤,滤液中含DNA

(7DNA:上述溶液+95%酒精,缓慢搅拌,出现乳白色丝状物,用玻璃

棒将丝装物卷起。

(8)鉴定:

实验关键:

本实验成功的关键是获取较纯净的DNA,因此应注意:

1.充分搅拌鸡血细胞液。DNA存在于鸡血细胞核中。将鸡血细胞与蒸馏水混合以后,应用

玻璃棒沿一个方向快速搅拌,使血细胞加速破裂,并释放出DNA

2.沉淀DNA必须用冷酒精。实验前必须准备好大量95%的酒精,并在冰箱中(5℃以下)至

少存放24小时。

3.正确搅拌含有悬浮物的溶液。在第(3)、(5)步骤,玻璃棒不要直插烧杯底部,且搅拌

要轻缓,以便获得较完整的DNA分子。在步骤(7),要将玻璃棒

插入烧杯溶液中间,用手缓慢转动5-10min。

【同类题库】

.在“DNA的粗提取与鉴定”的实验中分别使用2mol/L、0.14mol/L、2mol/L、0015mol/L的氯化钠溶液,其作用分别是(A)

A.溶解、析出、溶解、溶解 C.溶解、溶解、析出、溶解

B.析出、溶解、析出、溶解 D.溶解、析出、溶解、析出

.下列图示中能反映DNA溶解度与NaCI溶液浓度之间关系的是(C)

高中生物必修二实验十一DNA的粗提取与鉴定

.DNA在下列哪种浓度的NaCl溶液中溶解度最低(B)

A.2.00mol/L B.0.14 mol/L C.0.015 mol/L D.0.10 mol/L

.在DNA的粗提取过程中,初步析出DNA和提取较纯净的DNA所用的药品的浓度和名称分别是(B)

①0.1 g/ml的柠檬酸钠溶液 ②2.00mol/L的NaCl溶液 ③0.14 mol/L的NaCl溶液 ④体积分数为95%的酒精溶液 ⑤0.015 mol/L的NaCl溶液 ⑥0.04 mol/L的NaCl溶液

A.①③⑤ B.③④ C.②④ D.②③④

.与析出DNA粘稠物有关的叙述,不正确的是(C)

A.操作时缓缓滴加蒸馏水,降低DNA的溶解度

B.在操作A时,用玻璃棒轻缓搅拌,以保证DNA分子完整

C.加蒸馏水可同时降低DNA和蛋白质的溶解度,两者均可析出

D.当丝状粘稠物不再增加时,此时NaCl的浓度约为0.14mol/L.

.(多选)下列有关“DNA粗提取”的操作中,正确的是(ABCD)

A.在鸡血细胞液中加入蒸馏水

B.在“析出DNA粘稠物”时,要缓缓加入蒸馏水,直至溶液中粘稠物不再增多

C.在用酒精凝集DNA时,要使用冷酒精

D.用玻璃棒搅拌时要沿一个方向

.“DNA的粗提取与鉴定实验”中有三次过滤:

(1)过滤用蒸馏水稀释过的鸡血细胞液。

(2)过滤含粘稠物的0.14mol/L NaCl .

(3)过滤溶解有DNA的2mol/L NaCl.

以上三次过滤分别为了获得(A)

A.含核物质的滤液、纱布上的粘稠物、含DNA的滤液

B.含核物质的滤液、滤液中DNA粘稠物、含DNA的滤液

C.含核物质的滤液、滤液中DNA粘稠物、纱布中DNA

D.含较纯的DNA滤液、纱布上粘稠物、含DNA的滤液

.为获取较纯净的DNA,采集来的血样可用蛋白酶处理,然后用有机溶剂除去蛋白质。下列有关叙述,正确的是(D)

A.除去血浆中的蛋白质 B.除去染色体上的蛋白质

C.除去血细胞表面的蛋白质 D.除去血细胞中所有的蛋白质

.在“DNA的粗提取与鉴定实验”中,和“使用蛋白酶从染色体中提取DNA”中的蛋白酶具有相似作用的物质是(D)

A.NaCl溶液 B.蒸馏水 C.柠檬酸钠 D.冷却的酒精 .DNA不溶于下列何种溶液(D)

A.NaCl溶液 B.KCl溶液 C.MgCl溶液 D.酒精溶液 .下列不同浓度的NaCl溶液中,使DNA析出最彻底和溶解度最高的是(A)

①0.14mol/L ②2mol/L ③0.25mol/L ④0.015 mol/L

A.①和② B.②和① C.②和③ D.②和④

.下列操作中,对DNA的提取量影响较小的是(B)

A.使鸡血细胞在蒸馏水中充分破裂,放出DNA等核物质

B.搅拌时,要用玻璃棒沿一个方向轻缓搅动

C.在析出DNA粘稠物时,要缓缓加入蒸馏水,直至溶液中粘稠物不再增多

D.在用酒精沉淀DNA时,要使用冷酒精,甚至再将混合液放入冰箱中冷却

E.在DNA的溶解和再溶解时,要充分搅拌

.在“DNA的粗提取与鉴定实验”中:

(1)实验中两次使用蒸馏水,第一次目的是 , 第二次目的是 。

(2)说明不同浓度的NaCl溶液的作用:

2mol/L NaCl的作用 ;

0.14mol/L NaCl的作用 ;

0.015 mol/L NaCl的作用 ;

(3)提纯DNA的原理是 ,所用试剂为 。 搅拌要 ,目的 。

(4)能否用哺乳动物血液代替?简述理由。 。

[(1)使血细胞吸水破裂,溶解细胞核内的DNA;降低NaCl溶液的浓度,降低DNA分子在NaCl溶液中的溶解度析出DNA分子(2)溶解含DNA的核物质;使含DNA的丝状粘稠物析出DNA分子;进行DNA鉴定(3)DNA不溶于酒精溶液,但细胞中某些盐类蛋白质可溶于酒精溶液;95%的冷却酒精;轻缓、同方向;保持DNA分子的完整性(4)不能,成熟的哺乳动物红细胞没有细胞核]

.此实验中有几次用玻璃棒搅拌,每次搅拌的方向是一致的;但每次搅拌的强度不同,请就此予以说明。

(1)提取鸡血细胞核内物质时,应 搅拌,目的是 。

(2)向含核物质的2mol/L NaCl 溶液滴加蒸馏水析出DNA粘稠物时,应 搅拌,目的是 。

(3)DNA粘稠物再溶解于2mol/L NaCl 溶液时,应 搅拌,目的是 。

(4)用95%的冷却酒精提取含杂质较少的DNA时,应 搅拌,目的是 。

[(1)快速;加速血细胞破裂(2)轻缓;尽量保持DNA分子的完整性(3)轻缓;尽量保持DNA分子的完整性(4)轻缓;保持DNA分子的完整性]

.以下是有关DNA的粗提取实验的阅读材料:

a.核酸极不稳定,在较为剧烈的化学、物理因素和酶的作用下很容易降解。在制备DNA时要加入DNA酶(水解DNA的酶)的抑制剂柠檬酸钠,以除去Mg,防止DNA酶的激活。

b.核酸中的DNA和RNA在生物体内均以核蛋白(由核酸和蛋白质组成)的形式存在,DNA核蛋白在1 mol/L NaCl 溶液中溶解度很大,但在0.14mol/L NaCl 溶液中溶解度很低;而RNA核蛋白溶于0.14mol/L NaCl 溶液。

c.用苯酚处理,可使蛋白质变性,且留在苯酚层内;在DNA溶液中加入2.5倍体积,浓度

为95%的酒精,可将DNA分离出来。此时DNA十分粘稠,可用玻璃棒搅成团取出。

d.DNA在强酸性环境下,水解产生脱氧核糖等小分子物质,它与二苯胺酸性溶液反应,能生成蓝色化合物。

e.实验材料与器械:柠檬酸钠溶液、石英砂、0.14mol/L NaCl 溶液、1 mol/L NaCl 溶液、苯酚、95%的酒精、二苯胺试剂、浓硫酸、花椰菜、研钵、烧杯、漏斗、玻璃棒、量筒、石棉网、酒精灯、吸管、试管等。

以下是DNA粗提取实验的步骤,请根据以上阅读材料回答有关问题:

(1)研磨:取10克花椰菜加适量的 、 和石英砂,研磨成匀浆。

(2)过滤。

(3)将滤液稀释6倍,其目的是: 。

(4)离心处理,产生沉淀。

(5)取沉淀物,臵于2毫升1 mol/L NaCl 溶液中,使DNA核蛋白再次溶解,再加2毫升苯酚充分震荡后静止,待其分层后弃其上层苯酚。这一步的目的是除去 。

(6)如何将剩余溶液中的DNA提取出来? 。

(7)如何证明提取物质确实是DNA分子? 。 其实验过程的要点是向放有DNA的试管中加入适量该试剂,混合均匀后,将试管臵于 中5min,待试管 后,观察试管中的颜色变化。这个实验也说明DNA耐 温,前次温度有利于 ,后次温度则有利于DNA 。

[(1)柠檬酸钠溶液、1 mol/L NaCl 溶液(3)使DNA核蛋白溶解度降低而析出(5)(DNA核蛋白中的)蛋白质(6)向下层溶液中加2.5倍体积,浓度为95%的酒精,此时用玻璃棒搅动,玻璃棒上成团的物质即是DNA(7)用适量浓硫酸处理提取物,再滴加二苯胺酸性溶液数滴,如有蓝色物质出现即可证明提取物为DNA。沸水浴;冷却;高;加快染色反应的速度;析出。]

.“DNA的粗提取与鉴定”实验中,A、B、C、D、E五个小组除下表中所列处理方法不同外,其他操作步骤均相同,而且正确,但实验结果却不同。

高中生物必修二实验十一DNA的粗提取与鉴定

(1) 。

(2)实验步骤(不包括实验材料)均正确,但得不到DNA的组别是 。

(3)沸水浴中试管颜色变蓝的组别是,其原因是 。

(4)B组实验不成功的最主要原因是 。

[(1)C、D 人的血浆中没有细胞结构,成熟的红细胞中没有细胞核,选用这些材料得不到DNA或得到的DNA很少 (2)C (3)A、E A 冷却的酒精对DNA的凝集效果较佳,该组使用的是25℃的酒精 (4)菜花细胞在蒸馏水中不能被破坏,得不到DNA(应采用研磨的方法)] .在“DNA的粗提取与鉴定”的实验中,有同学按书本知识和自己的思路,试做了如下实

验,请你判断实验结果。

(1)他把与柠檬酸钠混合的新鲜血液放在几层纱布上过滤,纱布上最主要的结构是 。

(2)他在含有DNA、RNA及蛋白质等的混合物中加入大量的物质的量浓度为2.0mol/L的氯化钠溶液后,通过搅拌后,放在几层纱布上过滤,他得到的滤液中一定含有实验目的中需要提取的成分是 。

(3)他在上述滤液中加入冷酒精(体积分数为95%),并用玻璃棒向—个方向搅拌,溶液中的丝状物的主要成分是 。

(4)他把含有DNA、RNA、蛋白质与氯化钠的混合溶液稀释成物质的量浓度为0.14mol/L的氯化钠溶液后,放在几层纱布上过滤,他得到的滤液中含量最多的成分是 。

[血细胞 DNA DNA 水]

.请利用如下实验材料做相关实验,再选择其中的一种实验材料,设计一个实验,以展示你的科学素养和创新才能。

高中生物必修二实验十一DNA的粗提取与鉴定

(1)如用上述材料做观察植物细胞的有丝分裂、叶绿体中色素的提取和分离、观察植物的向性运动等实验。你选择的最佳材料依次是(填图中序号即可) 。

(2)如用紫色洋葱表皮做完细胞的质壁分离及复原实验后,又用此装片观察细胞分裂,结果未观察到处于分裂期的细胞。请解释原因 。

(3)创新实验设计方案

实验课题:探究镍为植物生活所必需的矿质元素

材料用具:完全营养液甲、缺镍的完全营养液乙、适当的容器和固定材料、长势相似的玉米幼苗,含镍的无机盐。

方法步骤:

① ; ② ; ② 。 实验预期: 。 为进一步验证镍元素一定是必需元素.还应增加的实验步骤及结果是: 。

[(1)①⑤③(2)高度分化的细胞一般不能继续分裂(3)①取长势相似的等量玉米幼苗,编为甲、乙两组;②甲组用营养液甲培养,乙组用营养液乙培养,其余条件均相同且适宜;③定期观察并记录两组幼苗的生长情况。 实验预期:①若两组长势相似,则镍不是玉米生活所必需的营养元素;②若甲组生长正常,乙组生长不良,则镍是玉米生活所必需的营养元素。 在乙组缺镍的培养液中加入适量含镍的无机盐,若症状在不久后消失,则镍一定是玉米生活所必需的营养元素。]

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