第六章知识点总结
1103班 郑美辰 1130170178
本章的主要讲述内容是蛋白质结构预测。老师分别从引言、蛋白质二级结构预测、蛋白质三维结构预测、蛋白质空间结构比较这几个方面讲述。
经过这一章的学习,我对物质结构与功能相适应这一概念更有了深刻的理解,不只是蛋白质的结构决定功能,其它生物大分子结构与功能也有着密切的联系。而本章着重讲述了通过生物信息学的方法预测蛋白质的氨基酸序列如何形成二级结构和折叠成三级结构以及二级结构和三级结构的预测以及通过比较蛋白质的空间结构去发现属于同一家族的保守序列以及特定序列。首先,蛋白质活性的体现在于蛋白质的三维结构,而三维结构的形成取决于一级结构氨基酸的序列以及二级结构的形式,蛋白质有20种氨基酸形成,不同种氨基酸倾向于形成不同的二级结构(包括α螺旋、β折叠、β转角以及无规卷曲),如丙氨酸和谷氨酸易形成α螺旋;缬氨酸和异亮氨酸易形成折叠;脯氨酸和甘氨酸易终止螺旋;谷氨酸已于中断折叠。正是由于不同蛋白含有不同的二级结构导致了功能上的差别,如血红蛋白和肌红蛋白中含有大量的α螺旋;免疫球蛋白含有大量的β折叠。其次,下一步就是研究蛋白质折叠问题,这一问题将是阐明中心法则的根本问题。蛋白质可凭借相互作用在细胞环境(特定的酸碱度、温度等)下自己组装自己,这种自我组装的过程被称为蛋白质折叠。之后提出了“多肽链的氨基酸序列包含了形成其热力学上稳定的天然构象所必需的全部信息”的“自组装学说”。由此可寻找一种从蛋白质的氨基酸线性序列到蛋白质所有原子三维坐标的一种映射 。蛋白质结构预测主要有两大类方法:统计学方法(找规律)和理论分析方法。其中统计学方法较常用,对已知结构的蛋白质进行统计分析,建立序列到结构的映射模型,进而对未知结构的蛋白质根据映射模型直接从氨基酸序列预测结构叫统计学方法。包括:经验性方法、结构规律提取方法、同源模型化方法:当前预测结果最可靠的方法。而二级结构预测的依据:每一段相邻的氨基酸残基具有形成一定二级结构的倾向。二级结构预测的方法大体分为三代:第一代是基于单个氨基酸残基统计分析:从有限的数据集中提取各种残基形成特定二级结构的倾向,以此作为二级结构预测的依据;第二代预测方法是基于氨基酸片段的统计分析;第三代方法为考虑多条序列,准确度有了较大的提高。最常用的为Chou 和Fasman在19xx年提出的。是一种基于单个氨基酸残基统计的经验预测方法。通过统计分析,获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级
结构。每种氨基酸出现在各种二级结构中倾向或者频率是不同的。同时不同的二级结构有不同的预测规则,共分为4种:α螺旋规则、β折叠规则、转角规则、重叠规则。Chou-fasman预测方法原理简单明了,二级结构参数的物理意义明确,该方法中二级结构的成核、延伸和终止规则基本上反映了真实蛋白质中二级结构形成的过程,准确率在50%以上。) 19xx年Garnier,Osguthorpe,Robson三个人发明了GOR方法,GOR方法与Chou-fasman预测方法的区别是不仅考虑被预测位置本身氨基酸残基种类的影响,而且考虑相邻残基种类对该位置构象的影响。而且GOR方法预测螺旋、折叠、转角的准确率为65%。后来又有了基于氨基酸疏水性的预测方法(Lim方法——立体化学方法)这一方法在进行结构预测时考虑氨基酸残基的物理化学性质。
预测蛋白质三维结构的方法包括了同源模型化方法(任何一对蛋白质,只要两者序列相同部分超过30%,则他们具有相似的三维结构,即两个蛋白质折叠基本相同)、线索化方法(与远程同源有关)、从头预测方法(仅仅根据序列本身预测其结构)、分子力学方法、能量优化方法。最终是蛋白质结构域的比较,通过结构域比较可以找出同一家族的蛋白质的保守结构以及发现特定的空间结构,结构域是经蛋白折叠后可将在一级结构不相邻的位点在三级结构中紧密相邻,形成特定的功能部位,从而研究蛋白发挥功能的位点。如何预测结构域的相似性则通过寻找两个蛋白质空间点三元组重叠最多的几何变换。最终确定蛋白质是否属于同一家族。
通过这门课程的学习,我们可以了解到生物信息学在生物学领域应用前景越来越广阔,可以通过电脑操作预测各个生物大分子在生物体内的表现形式,正如这一章所讲的应用生物信息学去推测蛋白质的各级结构。这一方法避免了实验室繁琐的科研工作,有利于通过预测解析蛋白结构。所以对于未来科研工作,生物信息学的掌握是必不可少的。
第六章 教学知识点总结
第一节 教学的意义和任务
一、教学的概念:教学是在一定教育目的的规范下,教师的教与学生的学共同组成的一种教育活动。
教学与教育是部分与整体的关系,教学是学校进行教育的一个途径。教学是完成智育的主要途径,但不是唯一途径。
二、教学的意义
1、教学是传播系统知识、促进学生发展的最有效形式;
2、教学是进行全面发展教育、实现培养目标的基本途径;
3、教学是学校教育的主要(中心)工作。
三、教学的任务:
1、掌握科学文化基础知识、基本技能和技巧;
2、发展体力、智力、能力和创造才能;
3、培养正确的思想、价值观、情感与态度。
当代“教学”观变革:
1、从重视教师向重视学生的转变
2、从重视知识传授向重视能力培养转变
3、从重视教法向重视学法转移
4、从重视认知向重视发展转变
5、从重视结果向重视过程转变
6、从重视继承向重视创新转变
第二节 教学过程
一、教学过程的概念:
(一)教学过程理论的发展:
孔子的“学、思、行”思想;《学记》的“教学相长”、“藏息相辅”、“长善救失”等;朱熹的“朱子读书法”;王守仁的“知行合一”;苏格拉底“产婆术”;夸美纽斯推行班级授课制;卢梭能动的儿童观和自然主义的教育思想;赫尔巴特“三中心”、教学的教育性原则、“明了、联合、系统、方法”四阶段论;杜威、凯洛夫、赞科夫、布鲁纳等人的教学思想。 (二 )教学过程的构成要素:教师、学生、教学内容和教学手段
二、教学过程的性质
(一)教学过程是一种特殊的认识过程;1、间接性;2、引导性;3、简捷性。
(二)教学过程必须以交往为背景和手段;
(三)教学过程也是一个促进学生身心发展、追寻与实现价值目标的过程。
三、学生掌握知识的基本阶段
(一)传授/接受模式:
引起学习动机——感知教材——理解教材——巩固知识和技能——应用知识和技能——检查知识、技能和技巧的掌握情况
(二)问题/探究模式
明确问题——深入探究——作出结论
第三节 教学原则
一、教学原则的概念
教学原则是有效进行教学必须遵循的基本要求和原理。它既指导教师的教,也指导学生的学,应贯彻于教学过程的各个方面和始终。
二、我国中小学教学原则
(一)直观性原则
直观性原则是(直接经验)与(间接经验)(辩证统一规律)的反映。 直观一般包括三大类:实物直观,模像直观,语言直观 *贯彻直观性原则的基本要求是:
1、要根据中学学科的特点和实际,恰当地选择直观手段 2、直观教具要有代表性和典型性3、运用直观教具要和语言讲解结合起来 4、要防止为了直观而直观的偏向
(二)启发性原则
启发性原则是(教和学相互依存辩证统一规律)和(掌握知识与发展智力辩证统一规律)的反映。孔子、《学记》、苏格拉底的“产婆术” 贯彻启发性原则的基本要求是:、
1、激发学生的求知欲、学习兴趣和责任感。充分调动学生的主动性、积极性,倡导学生主动参与,乐于探索,勤于动手。
2、启发学生积极思考,指导学生思维方法,培养学生自立和独立工作的能力。
3、发扬教学民主。要尊重学业不良的学生、有过错和缺陷的学生、和自己意见不一致的学生,不伤害学生的自尊心。
(三)理论联系实际原则
理论联系实际原则是直接经验与间接经验辩证统一规律的反映。在西方,古希腊智者派认为,没有实践的理论和没有理论的实践都没有意义。乌申斯基也指出:“理论不能脱离实际,事实不能离开思想。”毛泽东同志多次指出:“对于马克思主义的理论,要能够精通它、应用它、精通的目的全在于应用。”
贯彻理论联系实际原则的基本要求是:
1、正确处理感知与理解的关系。在教学中教师一方面要重视联系实际,使学生在感性认识的基础上向理性飞跃;另一方面也要重视学生从抽象到具体的思维发展过程,指导学生善于在已经形成的概念基础上去认识新的具体事物,促使概念向更高水平发展。 2、处理好理论与实际的关系。
3、教学中应注意联系三个方面的实际。第一,教学实践;第二,中学生本身实践;第三,社会实践
(四)科学性与思想性统一原则
贯彻科学性与思想性统一原则的基本要求是:
1、保证教学的科学性。
2、教师要用马克思主义的立场、观点和方法,深入研究课程准和教材,挖掘教材内在的思想因素,有目的地对学生进行情感态度和价值观的教育。 3、教师要加强自身修养。
(五)巩固性原则
孔子要求“学而时习之”,“温故而知新”。俄国的乌申斯基认为复习是学习之母,这个比喻非常精辟,道出了巩固知识对教学的重要意义。 贯彻巩固性原则的基本要求是:
1、要使学生在理解的基础上巩固。比如年代、人名、单词等本身需要机械记忆,但是教学中的大部分内容本身具有一定意义。
2、要及时地组织学生进行系统的复习和练习。 3、要指导学生掌握记忆的方法。
(六)循序渐进原则
《学记》中“不凌节而施”“学不塌等”的思想。 贯彻循序渐进原则的基本要求是:
1、教师应按照中学课程内容的逻辑体系进行教学。 2、教师应根据中学生发展的“序”抓好教学。
3、教师既要循序,使教材内容和教学进度适合学生的接受能力,又要使教学内容有一定的难度,使学生“跳一跳,够得着”,这样才能使他们有所提高,才能促进他们的发展。
(七)因材施教原则
我国首倡“因材施教”者应为孔子。 贯彻因材施教原则的基本要求是:
1、教学中教师首先要考虑中学生的年龄特征,根据不同年龄阶段学生的特点进行教学。 2、教学中,教师还应了解每个中学生的特点,有针对性地进行教学。 3、正确对待“先进生”和“后进生”。
第四节 教学方法
一、教学方法概述
(一)教学方法是为完成教学任务采用的教师教和学生学的共同(活动方式)的总称。
(二)教学方法的选择
1. 教学目的和任务
2. 教学过程规律和教学原则
3. 本门学科的具体内容及其教学法特点
4. 学生的可接受水平,包括生理、心理、认知等
5. 教师本身的条件,包括业务水平、实际经验、个性特点
6. 学校与地方可能提供的条件,包括社会条件、自然环境、物质设备等
7. 教学的时限,包括规定的课时与可利用的时间
8. 预计可能取得的真实效果
二、我国中小学常用的教学方法
(一)(讲授法)是指教师运用口头语言,系统连贯的向学生坚守课程内容的方法。它是中小学各科教学的一种主要教学方法,具体包括(讲述、讲解、讲读和讲演)。
运用讲授法的基本要求是:
1、要把高难度的思想性和严密性的科学性有机地统一起来。 2、要经常提出一些具有启发意义的问题,促进学生积极地思考。 3、要讲究语言艺术。 4、可恰当运用板书和教具。
(二)谈话法(提问):是教师在学生已有知识经验的基础上提出问题,引导学生积极思考,通过师生交谈,使学生获得知识技能、提高能力、培养思想品德的一种教学方法。 运用谈话法的基本要求是:
1、教师要充分作好谈话前的准备。
2、问题的提出要明确、具体、难易适中,富有启发性。
3、在谈话进程中,要抓住学生思维发展的脉络,提出问题,因势利导,逐步引出结论。 4、教师要掌握提问的技巧。
(三)(讨论法)是学生在教师指导下,由全班或小组成员围绕教师提出的议题,相互交流,发表自己的见解,最终弄清问题的一种方法。
运用讨论法的基本要求是:
1、讨论的题目要有价值。
2、讨论前应作好充分的准备。
3、讨论时,要引导学生充分表达自己的观点。 4、讨论结束时,教师应进行小结。
(四)读书指导法,是教师指导学生通过阅读教科书和参考书等材料,以获得知识、培养自学能力以及发展其他素质的一种教学方法。 读书导法包括(指导学生预习)、(复习教科书)、(阅读参考书)和(自学材料)等。
(五)演示法,是教师在课堂上向学生展示各种实物,教具,音像资料或作示范实验,以指导学生通过观察,获取关于事物的感性认识,说明、印证和巩固可通所讲内容的一种教学方法。 (演示法)直观性强。
(六)参观法
教师根据教学目的,组织学生到校外一定的场所,对实际事务进行观察,研究,从而获得知识或巩固验证已学知识的一种方法。
(参观法)可以丰富教学内容,把课堂学习和实际生活结合起来。
(七)练习法 (练习法),学生在教师指导下运用知识去反复完成一定操作以形成技能技巧的一种教学方法。
(八)实验法 (实验法),是学生在教师指导下,运用一定的仪器设备进行独立操作,以获得与验证知识的一种教学方法。
(九)实习作业法 (实习作业法),是教师根据课程标准的要求,组织学生在校内外参加实践活动,进行实际操作,把书本知识运用于实践的一种教学方法。
“发现法”是由美国的教学心理学家(布鲁纳)在20世纪60年代提出的。
第五节 教学组织形式
一、教学组织形式的发展
(一)教学组织形式是指为完成特定的教学任务,教师和学生按一定要求组织起来进行活动的结构。
(二)教学组织形式的历史发展
历史上最早的教学组织形式是(个别教学)。
17世纪捷克的教育家夸美纽斯总结了前人和自己的教学经验,在其所著的《大教学论》中,对班级授课制作了理论上的阐述和论证。
我国最早采用班级授课制的是(1862年)清政府在北京开办的(京师同文馆)。
道尔顿制是由美国的H.H.(柏克赫斯特)于19xx年在马萨诸塞州道尔顿中学创建的一种新的教学形式组织。
道尔顿制的显著特点是重视学生(自学)和(独立作业)。
(三)当代国外教学组织形式的改革
1、小队教学 2、朗特普制 3、小组合作学习 4、开放教学
(开放教学)的特点是在教室内分成几个“兴趣区”;教学活动没有固定结构;以学生的兴趣为中心;在活动中学习;不分年级,也不按能力分组;教师的职责是引导、建议、鼓励和帮助,创造一种令学生喜爱的环境。
二、教学基本组织形式——班级授课制
班级授课制也叫课堂教学,它是一种集体教学形式。它把一定数量的学生按(年龄)和(知识程度)编成固定的班级,根据周课表和作息时间表,安排教师有计划地向全班学生(集体上课)的一种教学组织形式。
班级授课制特点:
1、以“班”为学生人员组成的单位 2、以“课时”为教学的时间单位 3、以“课程表”为教学活动的基本周期 4、以“课”为教学活动的基本单位
(一)对班级授课制的评价
优点:
1、把学生按年龄和知识水平编成班级,使学生成为一个集体,可以互相促进和提高
2、教师按固定的时间表,同时对几十名学生进行教学,扩大了教育对象,提高了教学工作 的效率
3、在教学内容和时间方面,有统一的规定和要求,使教学工作能有计划、有组织地进行,有利于提高教学质量
4、各门学科轮流交替上课,课与课之间有一定的间歇和休息,既能扩大学生的知识领域,又能减轻学生的疲劳,符合学生大脑活动的规律和用脑卫生
缺点:班级授课制的最大缺陷是不能照顾学生的个别差异,不利于培养学生的特点和发展他们的个性。
三、教学的辅助形式
作业、参观、讲座、辅导
四、教学的特殊形式
教学的特殊形式是(复式教学)。
五、教学工作的基本环节
教学工作的基本环节是备课、上课、课后教导工作(包括作业、辅导、学生思想教育)、学业评价,其中(备课)是教学工作的基础和前提,(上课)是教学工作的中心环节,作业的布置与批改、课外辅导、学业评价是教学工作不可缺少的重要环节。
(一)、备课
1、备课的意义
(备课)是指教师在上课前的准备工作,具体地说是指教师在课前钻研教材,了解学生,设计适当的教学策略与方法,创造必要的教学环境与条件,以便使新的教学活动与学生原有的认知水平和心理发展水平相适应的教学准备过程。
2、备课应做的工作
1、备教材 2、备学生 3、备教材
备教材时,要着重解决以下几个方面的问题:(1)确定具体的教学目标 (2)突出重点,解决难点( 3)领会插图,认真准备插图、挂画和板画( 4)钻研习题,认真准备练习和作业( 5)备提问
3、备课应写的计划
备课要相应地编制出三个计划:(1)学期(或学年)教学进度计划( 2)课题(单元)计划( 3)课时计划(教案)
(二)上课
上课是整个教学工作的中心环节
上好一堂课的要求(或一堂好课的标准)
1、教学目的明确 2、教学内容明确 3、教学方法恰当 4、教学组织得好 5、师生互动得好6、教师要有全面扎实的教学基本功 (掌握和利用现代信息技术)是当代教师必备的基本功。 (学业评价)是教学评价的重要组成部分,主要是指以国家的教育教学目标为依据,运用恰当的、有效的工具和途径,系统地收集学生在各门学科教学和自学的影响下认知行为上的变化信息和证据,并对学生的学习水平进行价值判断的过程。
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